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CENTRO DE INVESTIGACION DEL CANCER

Proteomics Unit

Descripción del Servicio

            El Servicio de Proteómica del Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca ofrece servicios proteómicos avanzados y de coste optimizado para el apoyo a la investigación. Para mantener un alto nivel de calidad en nuestros servicios desarrollamos procedimientos normalizados de trabajo y llevamos a cabo controles de calidad de nuestros equipos (contamos con el certificado de Calidad ISO 9001).

            Ofrecemos asesoramiento sobre análisis proteómico basado en espectrometría de masas  y trabajamos para satisfacer las necesidades de la investigación en proteómica  implementando nuevos servicios o modificando los existentes de acuerdo con los últimos avances tecnológicos y la información aportada por los investigadores.

            El Servicio está incluido actualmente en la Plataforma de Recursos Biomoleculares del ISCIII, (https://prb3.org) a través de ProteoRed (PT17/0019/0023) durante el periodo 2018-2020.

Tarifas Unidad Proteómica 2020

 

EQUIPAMIENTO:

Equipos de separación

  • Ettan IPGPHOR, Ettan Dalt-6 Electrophoresis system, Hoefer SE 600 Ruby y Hoefer miniVE electrophoresis (Amersham, GEHealthcare) y Protean Xi cell (Bio-Rad)

Sistema de Electroforesis 2D y electroforesis vertical en gel 1D.

 electroforesis

  • HPLC1100 series (Agilent)

Equipo de cromatografía líquida de alto rendimiento.

hplc1000

  • 3100 OFFGEL (Agilent)

Equipo de fraccionamiento en solución por punto isoeléctrico.

offgel3100

Equipos LC-MS/MS

  • NanoAcquity (Waters)-LTQ Orbitrap velos ETD (Thermo)

 nanoacquire

Consta de un sistema de cromatografía líquida nanoUPLC nanoAcquity (Waters) acoplado a un equipo de espectrometría de masas LTQ Orbitrap velos con ETD (Thermo).

  • NanoElute-TIMSTOF PRO (Bruker)

Consta de un sistema de cromatografía líquida nanoUPLC nanoElute (Bruker) acoplado a un equipo de espectrometría de masas TIMSTOF PRO (Bruker).

nanoflute

 

SERVICIOS OFERTADOS:

  • SEPARACIÓN DE PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS.
  • IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS MEDIANTE LC- MS/MS.
  • CUANTIFICACIÓN RELATIVA DE PROTEÍNAS MEDIANTE LC- MS/MS.
  • CARACTERIZACIÓN DE MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES MEDIANTE LC- MS/MS.
  • SEPARACIÓN DE PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS.
    • Electroforesis
      • Elaboramos geles de las siguientes dimensiones: 10x8 cm (minigel); 16x14 cm; 18,5x20 cm; 26x22 cm. Realizamos distintos tipos de tinciones compatibles con espectrometría de masas.
    • Electroforesis Bidimensional
      • Realizamos isoelectroenfoques en tiras de  7, 13, 18 o 24 cms y una segunda dimensión de 10x8 (minigel), 16x14, 18.5x20 o 26x22 cms. Realizamos distintos tipos de tinciones compatibles con espectrometría de masas.
    • Fraccionamiento por punto isoeléctrico OFFGEL
      • Fraccionamos péptidos y proteínas en tiras de 12 y 24 cms de acuerdo a su punto isoeléctrico en el sistema Agilent OFFGEL 3100. 
    • Fraccionamiento por HPLC
      • Disponemos de un HPLC 1100 series analítico (Agilent) para el fraccionamiento de proteínas o péptidos.
    • Microfraccionamiento por SPE
      • Utilizamos filtros de SPE para fraccionar o desalar muestras de péptidos.
  • IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS MEDIANTE LC MS/MS.

            Los péptidos resultantes de la digestión de la muestra proteica con tripsina u otras endoproteinasas son separados mediante un gradiente cromatográfico en un sistema de cromatografía nano-UPLC y analizados por el equipo de espectrometría de masas acoplado. La longitud del gradiente cromatográfico es elegida según la complejidad de la muestra.

 

  • CUANTIFICACIÓN RELATIVA DE PROTEÍNAS MEDIANTE LC-MS/MS
    • Label Free – LC-MS/MS
      • La cuantificación relativa de proteínas se realiza mediante la comparación de los perfiles cromatográficos de sus péptidos obtenidos mediante análisis LC-MS/MS. 
    •  Cuantificación relativa mediante SILAC
      • SILAC es una técnica de cuantificación precisa basada en marcaje de proteínas con aminoácidos con isotopos estables añadidos en cultivo celular antes de su digestión y análisis por LC-MS/MS.

 

  • CARACTERIZACIÓN DE MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES MEDIANTE LC MS/MS.

         Realizamos la caracterización de modificaciones postraduccionales en muestras proteicas simples o complejas. La caracterización de modificaciones en muestras complejas requiere normalmente un enriquecimiento previo de los péptidos modificados.

            Los servicios ofertados están sujetos a las tarifas (sin IVA) disponibles en pdf en esta web, no obstante estas tarifas pueden ser modificadas según el diseño experimental de cada proyecto analítico, lo que queda reflejado en el presupuesto ofertado.

Para más información, por favor contacte con el Servicio y estaremos encantados de poderle ayudar.

 

Contacto:

Tel: 666 595771

nibarrola@usal.es

romade@usal.es