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CENTRO DE INVESTIGACION DEL CANCER

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Revisada la aparición de m5C en el ARN

Revisada la aparición de m5C en el ARN

21/01/19

 

El artículo de revisión Post-transcriptional regulation by cytosine-5 methylation of RNA, publicado por la investigadora principal Sandra Blanco, del Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC), lleva a cabo un análisis de los últimos avances en el conocimiento del papel fisiopatológico de la metilación citosina-5 (m5C) del ARN así como la eficacia de las técnicas disponibles para analizar su distribución en el transcriptoma.

  • Se concluye que se requiere mejorar las técnicas actuales de detección, así como aumentar el número de estudios de detección de m5C en ARN. La mejora puede venir con el uso complementario de las nuevas técnicas basadas en la espectrometría de masas o secuenciación masiva. Además, se requerirá el desarrollo de herramientas robustas de análisis de datos.

 

  • Por otra parte, se apunta a la necesidad de emplear nuevos modelos y organismos modificados genéticamente para comprender la función biológica de esta modificación posttranscripcional.

Gracias al surgimiento de nuevas tecnologías de secuenciación de alto rendimiento y el uso de métodos de detección de modificaciones de ARN ha permitido la detección de modificaciones de ARN a una resolución de un solo nucleótido, por tanto, se está consiguiendo la resolución de las piezas básicas que regulan la función del ARN y ADN y una visión más completa de las vías de regulación postranscripcional de los genes.

En la revisión efectuada se ha analizado la aparición de m5C en el transcriptoma, es decir dentro de la colección completa de ARN en una célula. Desde el punto de vista funcional este trabajo puede mejorar la comprensión de la regulación de varios procesos celulares y fisiológicos como puede ser el desarrollo, la diferenciación y la supervivencia a estímulos de estrés. Además, pueden facilitar la comprensión de procesos patológicos que van desde síndromes neurológicos hasta el cáncer. 

Mediante esta publicación se destaca cómo m5C tiene un papel central como marca epigenética en el ADN (es decir, las modificaciones en el ADN que no afectan a la secuencia misma), pero aún es necesario profundizar en su función en el ARN. De hecho, todo parece indicar que tiene un papel esencial en la fisiología humana, y es crucial avanzar en la identificación de sus cambios epigenéticos, así como de las proteínas que permiten escribir, borrar o leer sus marcas.

Para abrir profundizar en el abordaje del cáncer, el estudio remarca la necesidad de caracterizar el papel de m5C, así como en comprender la actividad de las metiltransferasas de ARN. 

Del mismo modo, los hallazgos recientes de que determinadas proteínas como ALKBH1 o TET también tienen la capacidad de oxidar m5C en el ARN, pueden conducir a enfermedades humanas. Este tipo de investigación básica puede permitir desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico, así como dianas terapéuticas.

A pesar de la identificación de la metilación de la citosina-5 en el ARN y el ADN hace más de 40 años, todavía se está empezando a entender su función en el ARN y la mayor parte de nuestro conocimiento sobre la metilación de la citosina-5 se ha centrado en el ADN, y no en el ARN.